Louis Dupasquier commence par faire des relevés minutieux de l’architecture, de la statuaire et des vitraux. Il pense dès 1827 à éditer ses dessins et ce n’est qu’en 1842 que la publication de la Monographie de Notre-Dame de Brou commencera par les feuillets du texte de Didron.
Son dernier dessin daté connu est de 1848, année de sa nomination comme architecte diocésain de Belley et d’Autun ; désormais il se consacre à la construction et à la restauration des édifices religieux, essentiellement dans l’Ain.
Quand, en 1856, Louis Dupasquier entreprend des fouilles pour retrouver les caveaux de Brou, ce n’est pas pour jouer à l’archéologue mais pour répondre à une demande du préfet.